E se eu quiser preencher toda a área do canvas com as flores??

Olá, Ricardo.

O seu código quase está completo. Só faltou outro for na dimensão y.

Modifiquei isso. O código ficaria:

<canvas width="600" height="400"></canvas>

<script>

    var tela = document.querySelector('canvas');
    var pincel = tela.getContext('2d');
    pincel.fillStyle = 'lightgray';
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);

    function desenhaCirculo(x, y, raio, cor) {

        pincel.fillStyle = cor;
        pincel.beginPath();
        pincel.arc(x, y, raio, 0, 2*3.14);
        pincel.fill();
    }

    function desenhaFlor(x,y){

    desenhaCirculo(x, y, 10, 'red');
    desenhaCirculo(x-20, y, 10, 'orange');
    desenhaCirculo(x+20, y, 10, 'black');
    desenhaCirculo(x, y-20, 10, 'yellow');
    desenhaCirculo(x, y+20, 10, 'blue');

}

for(var x = 30; x < 600; x = x + 60){
    for(var y = 30; y < 600; y = y + 60){
        desenhaFlor(x, y);
    }
}

</script>

Espero ter ajudado.