Olá, Rafael! Como você está?

Desculpe a demora em respondê-lo mas vamos lá!

Você conseguiu solucionar o problema?

Realmente é um pouco estranho porque normalmente o UTF-8 já resolve o problema na maioria dos navegadores.

Precisamos lembrar que para o código funcionar é necessário manter o navegador atualizado e:

1. Salvar o arquivo após a modificação
2. Atualizar a página que estamos trabalhando ( pode apertar o botão de refresh/atualizar do navegador ou f5)

Caso os passos não tenham surtido o efeito desejado, há uma tabela com vários códigos que substituem os acentos:

á = \u00e1

à = \u00e0

â = \u00e2

ã = \u00e3

ä = \u00e4

Á = \u00c1

À = \u00c0

 = \u00c2

à = \u00c3

Ä = \u00c4

é = \u00e9

è = \u00e8

ê = \u00ea

ê = \u00ea

É = \u00c9

È = \u00c8

Ê = \u00ca

Ë = \u00cb

í = \u00ed

ì = \u00ec

î = \u00ee

ï = \u00ef

Í = \u00cd

Ì = \u00cc

Î = \u00ce

Ï = \u00cf

ó = \u00f3

ò = \u00f2

ô = \u00f4

õ = \u00f5

ö = \u00f6

Ó = \u00d3

Ò = \u00d2

Ô = \u00d4

Õ = \u00d5

Ö = \u00d6

ú = \u00fa

ù = \u00f9

û = \u00fb

ü = \u00fc

Ú = \u00da

Ù = \u00d9

Û = \u00db

ç = \u00e7

Ç = \u00c7

ñ = \u00f1

Ñ = \u00d1

& = \u0026

‘ = \u0027

Para funcionar você precisa substituir as letras com acentos pelos códigos, por exemplo:

//Entrada
alert("Este  \u00e9 um popup feito com JavaScript");
//Saída
alert("Este é um popup feito com JavaScript ");

No entanto esse processo dá uma baita trabalheira e não é muito recomendável :D

Espero que as informações tenham ajudado, fico à disposição!

Um abraço e bons estudos!