Olá Carlos,
É possível conectar o sequelize a uma API com um banco de dados já existente e populado; não é necessário criar as tabelas do zero como fazemos no curso, porém quando passamos a "responsabilidade" de conexão com o banco ao Sequelize é preciso que os models reflitam de forma precisa os campos e dados das tabelas.
Caso você queira utilizar recursos específicos de algum dos gerenciadores que o Sequelize não tenha implementado como método (o que parece ser o caso), ou precise escrever uma query mais complexa, existem as raw queries, por exemplo:
const users = await sequelize.query("SELECT * FROM `users`", { type: QueryTypes.SELECT });
O exemplo acima usa uma query simples de select, mas você pode substituir pela query SQL que quiser. Os exemplos de uso estão no link da documentação.
Espero ter ajudado!
Bons estudos ;)