Diferença de performance

Da forma como foi solicitado para fazer não dá qualquer diferença mesmo, e em alguns casso pode até aumentar ligeiramente o tempo, devido à inicialização de mais um objeto. Na prática, cria-se uma instância da classe como a JPAUtil uma vez, executa-se tudo o que é necessário e depois fecha-se a conexão com o banco. O problema não é criar uma classe separada, mas sim, o momento certo de abrir e fechar a conexão. Muitos sistemas são construídos mantendo-se a conexão aberta por períodos mais longos justamente quando a questão desempenho é mais significativa do que a escalabilidade horizontal, ou seja, a possibilidade de ter muitas conexões ao mesmo tempo.

Obrigado pela explicação Sandro.