Solução estranha, mas funcionou.

Então, consegui solucionar a questão (não como o professor sugeriu usando as boleanas que eu preciso estudar mais), mas me intrigou a demora para iniciar. (o que não achei ainda aqui no forum a explicação da inicialização). Então, eu resolvi (de forma muito simples) a demora para aparecer as imagens. Mas aí surge outro problema, demora (acho que uns 5 seg.) para iniciar a troca. Então, não está 100% ainda.

<!-- bandeiras.html -->

<canvas width="600" height="400"></canvas>

<script>

function desenhaBandeiraBrasil() {
    var tela = document.querySelector('canvas');
    var pincel = tela.getContext('2d');

    pincel.fillStyle="green";
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);

    pincel.fillStyle="yellow";
    pincel.beginPath();
    pincel.moveTo(300, 50);
    pincel.lineTo(50, 200);
    pincel.lineTo(550, 200);
    pincel.fill();

    pincel.beginPath();
    pincel.moveTo(50, 200);
    pincel.lineTo(300, 350);
    pincel.lineTo(550, 200);
    pincel.fill();

    pincel.fillStyle="darkblue";
    pincel.beginPath();

    pincel.arc(300, 200, 100, 0, 2* 3.14);
    pincel.fill();
}


function desenhaBandeiraAlemanha() {
    var tela = document.querySelector('canvas');
    var pincel = tela.getContext('2d');

    pincel.fillStyle = 'black';
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 133);

    pincel.fillStyle = 'red';
    pincel.fillRect(0, 133, 600, 133);

    pincel.fillStyle = 'yellow';
    pincel.fillRect(0, 266, 600, 133);
}

function limpaTela() {

        pincel.clearRect(0, 0, 600, 400);
    }

function trocaBandeira() {
    setInterval(desenhaBandeiraBrasil,3000);
    setInterval(desenhaBandeiraAlemanha,6000);
}
desenhaBandeiraBrasil();
trocaBandeira();

</script>