Olá, Weslley. Tudo bem?
Pelas pesquisas que realizei o backup devem funcionar em conformidade com as LGPD.
Pelo meu entendimento os backups devem ser feitos, pois é uma forma de garantir a proteção dos dados. Mas, esses dados tem um ciclo de vida definido dentro da empresa, e quando a finalidade do uso dos dados são cumpridas ou pedido a sua destruição, a empresa deve excluir o dado ou armazenar (em situações especificas e delimitadas por lei e órgãos competentes)
Porque a Lei Geral de Proteção de Dados visa limitar o armazenamento prolongado e desnecessário de dados e informações pessoais, então os backups de informações devem ser feitos de forma muito bem administrados (conferindo datas, cumprimento de finalidades e etc.)
A lei permite o armazenamento de dados por períodos mais longos, desde que seja justificado a necessidade baseada em algum dispositivo legal, caso contrário o contexto pode estar sobre a pena de armazenamento ilegal de informação.
Espero ter ajudado e bons estudos!