Oi Mateus

Para enviar um código aqui você precisa utilizar a opção de inserir bloco de código </> e inserir o código entre as crases.

<meta charset="UTF-8" />
<h1>Escreva os quatro primeiro digito da matricula</h1>
<input />
<button>Verificar</button>

<script>
  var valeDosSinos = [0055]
  var nacional = [0865, 0002]
  var estadual = [0048, 0020]
  var input = document.querySelector('input')
  input.focus()
  var proximo = 0
  input.value = ''
  input.focus()
  var achou = true

  function verValeDosSinos() {
    for (var posicao = 0; posicao < valeDosSinos.length; posicao++) {
      if (input.value == valeDosSinos[posicao]) {
        alert('Vale dos sinos')
        achou = true
        proximo = 0
        return proximo || achou
        break
      } else {
        proximo = 1
        achou = false
        return proximo || achou
      }
    }
  }
  function verEstadual(achou, proximo) {
    for (var posicao = 0; posicao < estadual.length; posicao++) {
      if (input.value == estadual[posicao]) {
        alert('Intercambio estadual')
        achou = true
        proximo = 0
        return proximo || achou
        break
      } else {
        proximo = 2
        achou = false
        return proximo || achou
      }
    }
  }
  function verNacional(achou, proximo) {
    for (var posicao = 0; posicao < nacional.length; posicao++) {
      if (input.value == nacional[posicao]) {
        alert('Intercambio nacional')
        achou = true
        proximo = 0
        return proximo || achou
        break
      } else {
        achou = false
        proximo = 0
        return proximo || achou
      }
    }
  }
  function verifica(achou, proximo) {
    if (achou == true || proximo == 0) {
      verValeDosSinos()
    }
    if (achou == false || proximo == 1) {
      verEstadual()
    }
    if (achou == false || proximo == 2) {
      verNacional()
    }
    if (achou == false || proximo == 0) {
      alert('Matricula inexiste no banco de dados!')
    }
  }

  var button = document.querySelector('button')

  button.onclick = verifica
</script>

Obrigado! Não tinha visto!

Mateus o que seria o achou e o proximo na função verifica?

O seu código está executando a função verifica, porem quando você chama ela clicando no botão você não passa nada para os parâmetros achou e proximo, assim não irá entrar em nenhum IF.

Eu achei que ele usava a variavel original, como façõ para colocar? coloco na função e retiro o parametro ou na função onclick passo esse parametro?

Quando o click chama a função verifica ele passa um parâmetro chamado Event com informações do elemento que foi clicado, então o primeiro parâmetro fica como essas informações e o segundo fica undefined, com isso você sobrescreve dentro da função o que estava lá fora (achou e proximo).

Se você retirar os parâmetros do verifica o seu código irá funcionar como espera.

valeu !!! Agora só quebrar a cabeça aqui hehehehe To nisso a manha inteira, isso que nem fui pra parte de front ainda!

Você já utilizou a ferramenta de debug do browser?