Olá João, tudo bem? Espero que sim!
O cálculo do p-valor não depende de qual nível de significância estivermos usando. Só iremos comparar o valor obtido com o valor 0.05, caso desejarmos ter um grau de confiança de 95%. Ou seja, teremos 5% de chance de rejeitarmos a hipótese nula quando ela for verdadeira.
Na Estatística, comumente os intervalos de confiança são definidos entre níveis de 90%, 95% e 99% onde cada um deles dependem do grau de confiança que queremos para nosso experimento.
O nível de confiança deve ser escolhido de acordo com o quanto você está disposto a analisar e ao tipo de estudo que está realizando, onde um nível de confiança menor ou maior pode descartar ou abarcar situações indesejadas e irão trazer risco uma vez que se trata de estatística que está sujeita a erros. Por exemplo, se quisermos testes mais rigorosos como no caso da área de saúde é mais adequado buscarmos um nível de confiança de 99%. Mas em casos mais brandos como em uma pesquisa populacional podemos usar 90% ou 95%.
Espero que tenha tirado sua dúvida.
Estou à disposição. Bons estudos!