O tipo de prototipação pode variar conforme o projeto, e é muito comum que façamos wireframes, rascunhos à mão, etc. A parte mais interessante do uso da prototipação é a validação de que sua ideia será realmente útil e se atenderá suas expectativas.
No projeto que estou atuando no momento, a prototipação do novo portal tem sido um dos nossos maiores desafios, buscando oferecer uma experiência do usuário assertiva e objetiva. Um projeto que levarei para a vida.