Olá Maurício, tudo bem?
É bastante utilizado sim. Mas como você falou, o terminal integrado nas IDEs facilitam o trabalho, então muitos desenvolvedores optam por utilizar dessa forma. Caso queira ver como funciona desse modo, confira esse artigo.
E caso você queira ver mais funcionalidades do terminal, recomendo esse curso de Linux I.
E sobre a IDE substituir o Git Bash, não necessariamente ele substitui 100%. Alguns comandos que fazemos no terminal/Git Bash não necessitam de utilizar a IDE, como por exemplo trabalhar em uma máquina EC2 (Elastic Compute Cloud) da AWS, nesse caso é mais usual utilizar apenas o terminal/Git Bash.
Espero que tenha ajudado e qualquer coisa, estamos à disposição!
Abraços e bons estudos 😄
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