Oi Lucas,
Se for pensar de uma maneira mais "purista" do clean arch, não seria legal adicionar as anotações do Bean Validation nos atributos das classes de domínio, pois você estaria misturando domínio com infra, já que o Bean Validation é uma lib de validação, ou seja, não faz parte do domínio e tem várias outras libs que poderíamos utilizar.
Mas, na realidade como o Bean Validation é uma especificação do próprio Java e acabou se tornando meio que "padrão" para esse tipo de validações, eu não me incomodaria em o utilizar, mesmo que nas classes de domínio, pois desse jeito é muito mais simples do que ter que separar essas validações.
Então essas são as considerações a se avaliar tal decisão, sendo que existem vantagens e desvantagens em cada escolha.
Bons estudos!