Solucionado (ver solução)
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Usando transitionend

Nao seria melhor fazer o controle do fadeout usando o "transitionend" ? ai poderiamos alterar o tempo de fadeout no css sem nos preocupar em reajustar o tempo no script. O código que usei funcionou, porém, teria alguma restrição ou problema, ou uma forma melhor de aplicá-lo? Obrigado.

var tabela = document.querySelector("#tabela-pacientes");

tabela.addEventListener("dblclick", function(event){

var exclui = event.target.parentNode;

    if (event.target.tagName =='TD') {
        exclui.classList.add("fadeout");

        addEventListener('transitionend', function() {
            exclui.remove();
        });
    }
});
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solução!

Fala aí Leo, beleza? Cara, umas das coisas boas em desenvolvimento é que geralmente existe N maneiras de resolver um problema, dificilmente terá que ser exatamente de um jeito específico.

O importante é chegar no resultado esperado, e isso vocÊ conseguiu, parabéns, continue assim \o/