Unidade de medida CSS para container

Alexandre, boa tarde!

Depende do projeto que está sendo criado e do conteúdo desse container. Se ela for o container principal dá pagina usar % talvez seja uma boa, mas depende da aplicação.

Eu vou deixar um link que pode te ajudar com essas questões

https://speakerdeck.com/hugobessaa/tres-habitos-para-escrever-css-escalavel

Espero ter ajudado e bons estudos!