Segui o conselho de outro tópico de utilizar o comando pscp para transferir o arquivo loja.war para a máquina remota. O comando funciona e eu vejo que o arquivo é uppado mas quando dou um 'ls' nada aparece, como se não houvesse nenhum arquivo. Testei criar uma pasta qualquer, ela aparece com o comando ls e consigo adicionar o caminho dela no comando pscp, que mostra o upload novamente, porem o arquivo loja.war também não aparece dentro desta pasta criada.
ps: estou utilizando w10 e o putty.