Fiz algumas pequenas alterações no código para chegar o mais próximo com a interação ao cliente.
let porcentagemDesconto = 0;
alert("Acima de 5000 voce ganha 10% de desconto\n Acima de 30000 você ganha 20% de desconto")
let quantidadeMilhas = prompt('Digite a quantidades de milhas:');
if (quantidadeMilhas >= 30000) {
porcentagemDesconto =porcentagemDesconto + 20;
} else if (quantidadeMilhas > 5000) {
porcentagemDesconto =porcentagemDesconto + 10;
}
alert('Você ganhou ' +porcentagemDesconto +'% de desconto');