Olá Juliana, beleza?
Espero que tenha conseguido identificar o seu problema, caso não, segue o código corrigido:
<meta charset = "UTF-8">
<script>
function pulaLinha() {
document.write("<br>")
}
function mostra(frase) {
document.write(frase)
pulaLinha();
}
var x = parseInt(prompt("Escolha o primeiro número"));
var y = parseInt(prompt("Escolha o segundo número"));
var soma = calculasoma(x,y);
function calculasoma(x, y) {
let soma = (x + y);
return soma;
}
mostra("O valor da soma é " + soma);
if(soma < 100) {
pulaLinha();
mostra("A soma é menor que 100");
} else {
mostra("A soma é maior que 100");
}
</script>
O único detalhe que vc esqueceu, foi de realizar a chamada da sua função "calculasoma" e atribuir o retorno a uma variável "soma", pois a mesma não estava declarada. (estava declarada somente dentro das funções, mas no entanto as variáveis dentro de função não possuem valor global, então ao sair da mesma são "apagadas").
Abraços!