Fiz o código como mostrado corretamente e segui todos os passos mostrados, verificando depois na página do github fornecida pelo próprio professor e percebi que o site mostra 2x a mensagem de "Erro! Preencha todos os campos", é algo proposital (se sim porque?) ou sem querer (como ajeitar?)?
Oi Phillip, tudo bem? boa tarde! eu percebi seu erro na hora! e ele esta no seu codigo, na linha 7 até a 9, vou te mostrar o erro:
Você primeiro colocou o: alert("Erro! preencha todos os campos");
E depois você repetiu ela, porque quando você colocou o: let mensagemDeErro = "Erro! preencha todos os campos"; você não repetiu a anterior, mas sim criou uma nova! e na proxima linha você repete essa nova frase! então o primeiro alert aparece, e depois a frase nova.
Como arumar?:
Só apague a linha 8 e 9 (inteira!), espero ter ajudado! se tiver mais alguma duvida manda de novo aqui!