Na parte do código que sorteia os números da mega sena, há uma falha, pois podem cair números repetidos.
alert("Muito bom! Agora vou sortear os números premiados. Clique em ok para eu fazer o sorteio.");
var numerosSorteados = [];
for(i = 0; i < 6; i++) {
numerosSorteados[i] = (Math.round(Math.random() * 59) + 1);
}
Não deveria haver uma verificação desses números?