Solução e desafio pessoal

Optei por fazer duas coisas:

1. Imprimir um loop que conta somente múltiplos de 3
2. Fazer o inverso, um loop que pule todos os múltiplos de 3

Contando somente os múltiplos

public class MultiplosTres {
    public static void main(String[] args) {
        // Fazer um loop de 0 a 100 que imprima todos os múltiplos de 3

        for(int multiplicador = 1; multiplicador <= 100; multiplicador++){
            if (multiplicador % 3 == 0){
                System.out.println("Nosso contador está em " + multiplicador);
            }

        }

    }
}

Pulando todos os múltiplos

    public class MultiplosTres {
    public static void main(String[] args) {
        // Fazer um loop de 0 a 100 que imprima todos os múltiplos de 3

        for(int multiplicador = 1; multiplicador <= 100; multiplicador++){
            if (multiplicador % 3 == 0){
                continue;
            }
            System.out.println("Nosso contador está em " + multiplicador);
        }

    }
}