Olá Artur, tudo bem?
Pelo que entendi, você está tendo dificuldades em encontrar a opção "Java Application" quando clica em "Run as", certo? Nesse caso, você pode tentar criar uma nova configuração de execução. Para fazer isso, clique em "Run configurations..." e, em seguida, selecione "Java Application" na lista de tipos de configuração. Depois, clique em "New launch configuration" e configure o nome do projeto, a classe principal e outras opções necessárias para a execução do projeto.
Quanto à sua segunda dúvida, a porta 3306 é a porta padrão para conexão com o MySQL. No entanto, é possível usar outras portas, desde que você configure corretamente o servidor e o cliente para usá-las. Se você escolheu a porta 1822 e configurou corretamente o servidor e o cliente, não deve haver problemas.
Espero ter ajudado e bons estudos!