Oii Vitor, tudo bem?
Nesse caso, para restaurar apenas UM banco de dados para o seu MySQL com o backup físico, é o mesmo processo que o instrutor realiza em aula.
A diferença que você vai deixar apenas a pasta do banco que você quer restaurar e a pasta #innodb, que é a pasta de configurações. De toda forma, não recomendo você apagar a pasta dos outros bancos de dados, deixe o backup físico desses bancos guardado em outro lugar e não esqueça de pausar o servidor antes de restaurar o banco de dados.
Se me permite dar uma dica, prefira os backups dump do MySQL. Se caso os arquivos do backup físico estiverem corrompidos, ao restaurar, vão continuar corrompidos, tá bom?
Espero ter ajudado. Qualquer coisa é só me falar, beleza? :)