A forma como resolvi para mostrar na tela o Código do Produto e Quantidade, não apenas o resultado do COUNT sem especificação:
SELECT [CODIGO DO PRODUTO], [QUANTIDADE], COUNT([CODIGO DO PRODUTO]) AS [CONTAGEM DA QUANTIDADE]
FROM [dbo].[ITENS NOTAS FISCAIS]
WHERE [CODIGO DO PRODUTO] = '1101035' AND QUANTIDADE = 99
GROUP BY [CODIGO DO PRODUTO], QUANTIDADE 