Solucionado
Uma das explicações foi que git init cria repositório conforme o exemplo a seguir:
Eu queria saber se eu preciso criar um repositório a cada projeto criado , ou faço uma vez e sempre vai ser aquele repositório.
Não é possível usar um repositorio para dois projetos. O Git tem suas vantagens, mas uma das desvantagens é justamente essa. O Git trabalha com o repositório como um todo. Na verdade é mais comum quando precisa de melhor organização e controle de acesso ter uma separação de projetos em partes e cada uma ter seu próprio repositório.
É evidente que pode, ainda que não recomendado, colocar ambos no mesmo repositório, mas será uma coisa só do ponto de vista do Git. Dá para fazer isto, mas qualquer tentativa de administrar como se fossem coisas separadas vai trazer mais confusão.
Separe em dois repositórios e seja feliz. Não tem porque não fazer isto.