Relacionamento entre coleções de Mapas (java.util.Map)

Eu consegui compreender o conceito dos relacionamentos em listas e tudo mais, mas surgiu uma dúvida que tentarei explicar em um exemplo prático:

Uma organização, possui departamentos e esses departamentos são gerenciados por um funcionário. Entretanto, existem várias organizações que utilizam esse departamento e cada uma delas possuem funcionários distintos como responsáveis.

Segue o código de exemplo:

Departamento.java

@Entity
public class Departamento {
    @Id
    @GeneratedValue(strategy = GenerationType.AUTO)
    private Long id;
    @NotNull
    private String nome;
    //...
}

Funcionario.java

@Entity
public class Funcionario {
    @Id
    @GeneratedValue(strategy = GenerationType.AUTO)
    private Long id;
    @NotNull
    private String nome;
    @NotNull
    private String cargo; 
    //...
}

Organizacao.java

@Entity
public class Organizacao {
    @Id
    @GeneratedValue(strategy = GenerationType.AUTO)
    private Long id;
    @NotNull
    private String nome; 

    // cada departamento possui um funcionário responsável 
    private Map<Departamento, Funcionario> departamentos; 
    //...
}

Como deve ser feito o mapeamento para que a tabela de relacionamento no banco de dados (organizacao_departamentos, por exemplo) fiquem com a seguinte estrutura?

mysql> desc organizacao_departamento;
+-----------------+---------+------+-----+---------+-------+
| Field           | Type    | Null | Key | Default | Extra |
+-----------------+---------+------+-----+---------+-------+
| id_organizacao  | int(11) | NO   | PRI | NULL    |       |
| id_departamento | int(11) | NO   | PRI | NULL    |       |
| id_funcionario  | int(11) | NO   | MUL | NULL    |       |
+-----------------+---------+------+-----+---------+-------+
3 rows in set (0.00 sec)

Sendo:

• id_organização e id_departamento chaves compostas e relacionadas com suas tabelas: organização e departamento, respectivamente;

• id_funcionario o funcionário responsável pelo departamento dentro da respectiva organização, conforme descrito pela chave composta.