Fala, Denis! Beleza?
Seguinte cara, antes de fazer o Pull, você é meio que obrigado a "commitar" tudo que tem no seu repositório, para evitar possíveis conflitos.
O Git quer uma garantia de que você está trabalhando com o código atual do projeto antes de fazer qualquer alteração.
Já houve um caso meu em que eu alterei algo em um lugar, e também na minha máquina. Quando fui pegar a atualização do lugar, fui impossibilitado, porque essas mudanças precisam ser commitadas, o ponto na história precisa ser criado, senão vai ser como algo não terminado.
Assim que você commitar, você dá pull que tá tudo certo, ou vice versa. Só toma cuidado com essas alterações por fora, porque o código pode acabar bugando todo, haha
Espero ter ajudado :D