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Qual seria a melhor forma de disponibilizar a aplicação ao cliente?

Em uma situação real de fornecimento de sofware para um cliente, no qual o cliente iria rodar a aplicação no server ou desktop. Qual seria a melhor forma de disponibilizar a aplicação ao cliente? Seria a maneira que o professor apresenou, com um arquivo exportado no formato .JAR executável? Este é o método utilizado no mercado? Existe uma forma de proteger o acesso às classes do projeto e impedir que o seu arquivo .JAR seja importado para um outro projeto?

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Oi Emerson

.jar, .war e .ear são formas amplamentes usadas no mercado. O arquivo .jar é o bytecode após compilação, como não é o código fonte já é uma forma de "segurança" da aplicação.