Boa tarde Leonardo,
Acho que dependeria da visão holística.
Se você quer saber o serviço principal, olhando ao todo, seu serviço principal seria a educação, os cursos, aulas, etc, independente do exemplo 1 ou 2 que você mencionou.
No exemplo 1: Seu serviço de TI (SITE), seria um serviço intensificador, ou seja, que agrega valor ao serviço principal, mas mesmo sem ele seu serviço principal não para de funcionar.
No exemplo 2: Aqui seu serviço de TI (SISTEMA) seria um serviço secundário. Um serviço que sem ele não seria possível a execução do serviço principal. Pois sem os dados de alunos, professores e todo o resto seria impossível oferecer qualquer tipo de curso/aulas sem essas informações.
Isto tudo pensando no todo.
Agora pensando só em TI, no exemplo 1, seu site continuaria a ser um serviço intensificador . O serviço principal seria muito provavelmente um sistema onde é guardado e processada toda informação necessária para a execução do que você se propôs a ofertar, que seria os cursos e aulas. Claro, se por um milagre alguma organização operar sua gerencia e processos no papel, sem nenhuma tecnologia e o site for a unica coisa tecnológica, acho que poderia sim ser o serviço principal DE TI.
já no exemplo 2, seu serviço principal seria mesmo o sistema, pois estamos pensando em TI e este sistema é a parte vital, em TI, do seu negócio.