Consegui corrigir alguns erros olhando os outros tópicos do fórum e reassistindo algumas aulas. E consertando uns erros aparece outros que não tinha, não consigo mais nem gerar o token, e antes gerava.
Não consegui consertar essa exception: Caused by: org.springframework.data.mapping.PropertyReferenceException: No property 'pacienteId' found for type 'Paciente'
E na classe PacienteRepository um dos métodos está cinza, tem algum erro também. Não sei se tem ligação com a Exception.