No meu programa de teste, apenas o primeiro prompt aparece o texto ao usuário, os prompt´s seguintes aparecem apenas a caixa de texto. Segue a estrututa:
var temCnh = prompt ("voce possui CNH? ");
var suaIdade = parseInt(prompt ("Qual sua idade? "));
            if (suaIdade >= 18 && temCnh == 's'){
            mostra ("Pode dirigir");
            } 
                else {
            mostra ("Nao pode dirigir");
                }
    </script>