Oi José, tudo bem?
Uma opção é utilizar a biblioteca getpass do Python. Essa biblioteca permite que você solicite ao usuário que digite um valor sem exibir o que está sendo digitado. Dessa forma, você pode criar uma função que solicita o login e senha e utilizar os valores fornecidos pelo usuário na automação.
Aqui está um exemplo de como você pode usar a biblioteca getpass:
from getpass import getpass
login = getpass("Digite o login: ")
senha = getpass("Digite a senha: ")
# Utilize as variáveis 'login' e 'senha' na sua automação
Outra opção é utilizar bibliotecas de automação específicas, como o selenium, que permite interagir com elementos da web, incluindo prompts de login e senha. No entanto, você mencionou que não pode usar o pyautogui nessa RPA, então talvez essa opção também não seja viável para você.
Espero que essas sugestões possam te ajudar a lidar com o prompt de login e senha na sua automação.
Um abraço e bons estudos.