O problema principal seria a feita da inserção do "elif" no lugar do "else" para sucessivas condições
usuario = input("Informe o usuário do sistema: ")
if(usuario == "Flávio"):
print("Seja bem-vindo Flávio!")
elif(usuario == "Douglas"):
print("Seja bem-vindo Douglas!")
elif(usuario == "Nico"):
print("Seja bem-vindo Nico")
else:
print("Usuário não identificado!")