Olá, Ian!
Que legal que você conseguiu fazer o Pong no Scratch! É um ótimo projeto para praticar programação e lógica de jogo.
Sobre o problema que você está enfrentando, parece que há um erro no código responsável por marcar os pontos. Pode ser que você esteja incrementando a pontuação mais de uma vez a cada colisão.
Uma possível solução é revisar o trecho do código onde você incrementa os pontos e verificar se está sendo chamado apenas uma vez a cada colisão. Certifique-se de que a pontuação seja incrementada corretamente, adicionando apenas 1 ponto para cada jogador quando a bolinha colidir com as bordas.
Se você puder, abra um novo tópico aqui no Fórum e compartilhe o trecho do código responsável por essa lógica. Dessa forma, poderemos te ajudar a identificar o problema com mais precisão.
Bons estudos!