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Problemas ao utilizar Sonar

Bom dia. Na empresa onde trabalho tenho projetos que utilizam o Maven e Jenkins e projetos que não utilizam os 2. É possível rodar o Sonar em uma pasta preenchida com arquivos .java? E em projetos que utilizam mais de um repositório Git como resolver problema de dependências ao executar o sonar?

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Oi Carlos, tudo bem ?

O Sonar consegue ver seu projeto como um todo, até mesmo os .java.

Você vai ter que configurar um projeto para cada git, para o sonar conseguir ler cada projeto

O problema que os projetos se entrelaçam. Então qualquer um dos 2 que eu rode ele precisa do outro git