Olá Guilherme, tudo bem?

Isso pode estar acontecendo por conta de um problema na propriedade CSS "position" do seu rodapé.

Compartilha os seus códigos HTML e CSS completos aqui com a gente, assim fica melhor para ajudar.

Uma possível solução para esse problema seria definir a propriedade "position" do seu rodapé como "fixed" e a propriedade "bottom" como "0". Isso fará com que o rodapé fique fixo na parte inferior da página e não sobreponha os outros elementos.

Segue um exemplo de código CSS que pode ajudar:

footer {
   position: fixed;
   bottom: 0;
}

Espero que essa solução ajude a resolver o seu problema, se não resolver compartilha seus códigos. Caso ainda tenha alguma dúvida, é só perguntar!

Espero ter ajudado e bons estudos!