Porque a Função IMC não retorna o que solicito ?

Olá Alan, você esqueceu de passar os parâmetros para a função calculaIMC. Segue o ajuste.

<p><h3><big>COMO ESTA SEU PESO? SAUDÁVEL ?</big></h3></p>
<script>
    var pulalinha = function() {
        document.write("<br>");
    };
    var mostra = function (frase) {
        document.write(frase);
        pulalinha();
    };
    var calculaIMC = function(altura, peso) {
        var imc = peso / (altura * altura);
        return imc;
    };
    var peso = 75;
    var altura = 1.72;
    var imc = calculaIMC(altura, peso);

    mostra("O imc eh: "+ calculaIMC(altura, peso)); // pode ser chamado assim
    mostra("O imc eh: "+ imc); // ou assim pois vc ja atribuiu o valor da função à variavel imc


</script>

wooo vei, desculpa a minha ignorância do qual até eu mesmo estou me espantando,

lembra do mostra ? a função, por isso joguei o calculaIMC e nao o que está na 2º variavel.

var mostra = function (frase) {
    document.write(frase);
};

Você apenas esqueceu de passar os parâmetros(argumentos) para a função calculaIMC. Tipo isso: var calcularimc = functio(altura, peso) { var imc = peso / (altura * altura); return imc; };