O número é entendido como string sem os parênteses, pois não está explícita a prioridade da conta, já que antes dela tem a string "Seus pontos são " e o sinal de '+' depois dessa string vai tratar os demais elementos, mesmo sendo números, como strings também. Da mesma forma que na matemática 2+ 4/2 =4 e (2+4)/2=3 os parênteses fazem toda a diferença na interpretação do código, sem eles todos os 3 itens têm a mesma prioridade. Se uma string é somada a um número, ela trata esse número como string também e assim concatena, mas se um número é somado com outro número, é entendido como uma conta matemática e solucionado. Logo, nesse caso, apenas o resultado da conta é que precisa ser lido como string e concatenado, então tem que ser resolvido primeiro e são os parênteses que indicam isso, como na matemática. Sem os parênteses são 3 itens concatenados, mas com os parênteses são só 2 itens concatenados, pois o que está dentro deles acaba sendo considerado um elemento apenas, que é o resultado da conta.
Outra solução possível seria:
var resultado = (vitorias * 3) + empates;
mostra ("Seus pontos são " + resultado );
(Talvez ajude a entender que o número eventualmente vai ser tratado como string e concatenado ao texto para ser exibido na tela. O importante é ter a conta solucionada primeiro e no outro código são os parênteses extras que marcam e definem isso).