Solucionado (ver solução)
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Por que essa linha não tem nenhuma função?

<meta charset="UTF-8">

<script>

    function pulaLinha() {
        document.write("<br>");
    }

    function mostra(frase) {
        document.write(frase);
        pulaLinha();
    }

    var quantidadeCarbono1 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 1"));
    var quantidadeCarbono2 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 2"));

    quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2;

    if(quantidadeCarbono1 = quantidadeCarbono2 ) {

        mostra("Acho que são substâncias parecidas");
    } else {

        mostra("São substâncias bem diferentes");
    }

</script>

Alguém me explica por que em quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2; não existe nenhuma instrução aplicada, como var , por exemplo? É como se o var estivesse ali oculto?

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solução!

Oi Tales! Tudo bem com você?

O var é utilizado para declarar/criar uma variável. E as variáveis precisam ser declaradas apenas uma vez.

No caso da variável quantidadeCarbono2, essa foi declarada em var quantidadeCarbono2 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 2"));. Sendo assim, como ela já havia sido declarada, para atribuir um novo valor à ela, não é necessário que utilizemos o var novamente, basta apenas atribuir o novo valor desejado, conforme foi feito em quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2;.

Qualquer dúvida vamos nos falando por aqui, tá bom?

Espero ter ajudado.

Bons estudos!

Obrigado, Milena! Não sabia que depois de atribuir um valor eu poderia mudá-lo através de operações matemáticas sem ter problemas.