Por que com um símbolo de igual dá errado?

Boa tarde pessoal, implementei o código errado e o correto para treinar. Consegui entender que um símbolo de igual significa que a variável à esquerda recebe o que está à direita do símbolo. Acontece que fiquei na dúvida: porque dentro do if se tiver apenas um símbolo não funciona? No meu ver, a linha a seguir significa: "Se (a variável quantidadeCarbono1 recebe o conteúdo da quantidadeCarbono2){}

if(quantidadeCarbono1 = quantidadeCarbono2){  }

Sendo assim, porque não funciona, sendo que em nenhum momento anterior do código a variável quantidadeCarbono1 recebeu o conteúdo da variável quantidadeCarbono2?

Obrigado a quem puder esclarecer.

Segue o código completo:

<meta charset="utf-8">

<script>
  function pulaLinha(){
    document.write("<br>");
  }

  function mostra(texto){
    document.write(texto);
  }

  var quantidadeCarbono1 = parseInt(prompt("Digite a quantidade de carbono do elemento 1: "));
  var quantidadeCarbono2 = parseInt(prompt("Digite a quantidade de carbono do elemento 2: "));

  quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2;

  if(quantidadeCarbono1 = quantidadeCarbono2){
    mostra("Acho que são elementos parecidos!");
  }else{
    mostra("São elementos diferentes!");
  }

</script>