Lucas, mostra pra gente como você está tentando fazer por favor?

//Database
$mongoDbname  =  'nomedobanco';
//Coleção
$mongoTblName =  'produtos';
//Connect com banco
$manager      =   new MongoDB\Driver\Manager("mongodb://172.18.0.3:27017");

o ip que recebe é de um container do docker com mongo

Entendi. Seu código também está dentro de um container? Eles estão na mesma rede ou você está tentando acessar do seu host?