No Windows temos o Chocolatey, Scoop e o winget, que é mantido pela própria Microsoft e já vem em algumas versões do Windows.
Para Linux, na maioria das distros baseadas em Debian ou Ubuntu, o APT é o gerenciador de pacotes padrão. Em distros baseadas em Arch Linux, temos o Pacman, que na minha opinião é bem melhor que o APT. Além disso existem dezenas de outros baseados em várias outras distros e em projetos diferentes com propósitos diferentes.