Os dados não estão sendo recuperados ao Editar a lista

Fala ai Viktor, de boa ?

Seu helper tá certinho, consegue mostrar pra gente sua activity ?

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<RelativeLayout xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    android:layout_width="match_parent"
    android:layout_height="match_parent"
    android:orientation="vertical">

   <ListView
       android:id="@+id/lista_alunos"
       android:layout_width="match_parent"
       android:layout_height="wrap_content"/>

    <Button
        android:id="@+id/novoAluno"
        android:layout_width="56dp"
        android:layout_height="56dp"
        android:text="+"
        android:layout_alignParentRight="true"
        android:layout_alignParentBottom="true"
        android:textColor="#ffffff"
        android:textSize="40sp"
        android:layout_marginBottom="16dp"
        android:layout_marginRight="16dp"
        android:background="@drawable/fundo"/>




</RelativeLayout>

Queria ver o código da sua activity de formulario e da lista

package com.br.agenda;

import android.content.Intent;
import android.support.v7.app.AppCompatActivity;
import android.os.Bundle;
import android.view.ContextMenu;
import android.view.MenuItem;
import android.view.View;
import android.widget.AdapterView;
import android.widget.ArrayAdapter;
import android.widget.Button;
import android.widget.ListView;
import android.widget.Toast;

import com.br.agenda.dao.AlunoDAO;
import com.br.agenda.modelo.Aluno;

import java.util.List;

public class ListaAlunosActivity extends AppCompatActivity {


    private ListView listaAlunos;

    @Override
    protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
        super.onCreate(savedInstanceState);
        setContentView(R.layout.activity_lista_alunos);



        listaAlunos  = (ListView) findViewById(R.id.lista_alunos);


        listaAlunos.setOnItemClickListener(new AdapterView.OnItemClickListener() {
            @Override
            public void onItemClick(AdapterView<?> lista, View item, int position, long id) {
                Aluno aluno = (Aluno) listaAlunos.getItemAtPosition(position);


                Intent intentVaiproFormulario = new Intent  (ListaAlunosActivity.this, FormularioActivity.class);
                intentVaiproFormulario.putExtra("", aluno);
                startActivity(intentVaiproFormulario);
            }
        });

        Button novoAluno = (Button) findViewById(R.id.novoAluno);
        novoAluno.setOnClickListener(new View.OnClickListener() {
            @Override
            public void onClick(View view) {
                Intent intentVaiParaFormulario = new Intent(ListaAlunosActivity.this, FormularioActivity.class);
                startActivity(intentVaiParaFormulario);
            }
        });



        registerForContextMenu(listaAlunos);


        }

    private void carregaLista() {
        AlunoDAO dao = new AlunoDAO(this);
        List<Aluno> alunos =  dao.buscaAlunos();
        dao.close();


        ArrayAdapter<Aluno> adapter = new ArrayAdapter<Aluno> (this, android.R.layout.simple_list_item_1, alunos);
        listaAlunos.setAdapter(adapter);
    }

    @Override
    protected void onResume() {
        super.onResume();
        carregaLista();
    }


    @Override
    public void onCreateContextMenu(ContextMenu menu, View v, final ContextMenu.ContextMenuInfo menuInfo) {
        MenuItem deletar = menu.add("Deletar");
        deletar.setOnMenuItemClickListener(new MenuItem.OnMenuItemClickListener() {
            @Override
            public boolean onMenuItemClick(MenuItem item) {

                AdapterView.AdapterContextMenuInfo info = (AdapterView.AdapterContextMenuInfo) menuInfo;
                Aluno aluno = (Aluno) listaAlunos.getItemAtPosition(info.position);

                AlunoDAO dao = new AlunoDAO(ListaAlunosActivity.this);
                dao.deleta(aluno);
                dao.close();
                carregaLista();
                return false;
            }
        });
    }



}

public class FormularioActivity extends AppCompatActivity {

    private FormularioHelper helper;

    @Override
    protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
        super.onCreate(savedInstanceState);
        setContentView(R.layout.activity_formulario);

        helper = new FormularioHelper(this);

        Intent intent = getIntent();
        Aluno aluno = (Aluno) intent.getSerializableExtra("aluno");
        if (aluno != null){
            helper.preencheFormulario(aluno);
        }


    }

    @Override
    public boolean onCreateOptionsMenu(Menu menu) {

        MenuInflater inflater = getMenuInflater();
        inflater.inflate(R.menu.menu_formulario, menu);

        return super.onCreateOptionsMenu(menu);
    }

    @Override
    public boolean onOptionsItemSelected(MenuItem item) {

        switch (item.getItemId()){
            case R.id.menu_formulario_ok:

                Aluno aluno = helper.pegarAluno();

                AlunoDAO dao = new AlunoDAO(this);


                if (aluno.getId() != null){
                    dao.altera(aluno);
                    } else {

                    dao.insere(aluno);
                }


                dao.close();

                Toast.makeText(FormularioActivity.this, "Aluno " + aluno.getNome() + " Salvo!", Toast.LENGTH_SHORT).show();

                finish();

                break;
        }



        return super.onOptionsItemSelected(item);
    }
}

O problema está aqui:

listaAlunos.setOnItemClickListener(new AdapterView.OnItemClickListener() {
            @Override
            public void onItemClick(AdapterView<?> lista, View item, int position, long id) {
                Aluno aluno = (Aluno) listaAlunos.getItemAtPosition(position);


                Intent intentVaiproFormulario = new Intent  (ListaAlunosActivity.this, FormularioActivity.class);
                intentVaiproFormulario.putExtra("", aluno);
                startActivity(intentVaiproFormulario);
            }
        });

Dá uma olhada na chave que você está passando, não tem nada, do outro lado você está esperando a chave aluno.

Basta você colocar a chave e o restante, deve funcionar.