Você colocaria este top nas classes das suas tags?
Bom, explica melhor a sua dúvida pra poder te ajudar.
As classes top
do bootstrap na seção de menus , no geral, tem a intenção de fixar o seu menu no topo da janela.
O componente nav que aparece na seção responsiva tem as próprias configurações de funcionamento e elas são um pouco mais rígidas do que em outros frameworks como Zurb Foundation, Skeleton ou Materialize.
Como não entendi muito bem a sua pergunta, sugiro que dê uma olhada no componente deles para encontrar o que deseja
http://getbootstrap.com/components/#navbar
Nesse link você pára direto nas classes que controlam as tags "nav" do bootstrap.
Lembre-se , também, de não ficar preso para sempre ao bootstrap. Ele é apenas uma porta de entrada para o mundo dos frameworks, se permita pegar exemplos de outros frameworks como os citados acima para aumentar seu vocabulário e entender como o próprio bootstrap funciona.
Espero ter ajudado :)