Aquele exercício em que eu dei um gritinhos quando acertei de tão "simples" que é. Talvez meu problema em resolver "problemas" ajudou, mas:
<meta charset="UTF-8">
<script>
function pulaLinha() {
document.write("<br>");
}
function mostra(frase) {
document.write(frase);
pulaLinha();
}
var quantidadeCarbono1 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 1"));
var quantidadeCarbono2 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 2"));
quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2;
if(quantidadeCarbono1 **==** quantidadeCarbono2 ) {
mostra("Acho que são substâncias parecidas");
} else {
mostra("São substâncias bem diferentes");
}
</script>
Ao invés de usar == (igual) em if, Braga usou = (recebe). Ele não perguntou ao programa sobre igualdade, mas sobre atributo.