Onde está o erro de Braga?

O erro de Braga está em não utilizar o sinal de igual "==" certo na comparação "if", Ele havia utilizado o sinal "=" que quer dizer "recebe".

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<script>

    function pulaLinha() {
        document.write("<br>");
    }

    function mostra(frase) {
        document.write(frase);
        pulaLinha();
    }

    var quantidadeCarbono1 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 1"));
    var quantidadeCarbono2 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 2"));

    quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2;

    if(quantidadeCarbono1 == quantidadeCarbono2 ) {

        mostra("Acho que são substâncias parecidas");
    } else {

        mostra("São substâncias bem diferentes");
    }

</script>

Olá, Evaldo! Como vai?

Boa, é isso mesmo! No if, Braga usou apenas = ao invés de ==, o primeiro é um sinal de atribuição e o segundo é de igualdade.

Qualquer dúvida, estamos à disposição.

Abraços!