o Segundo if apresenta um bug.

Se o comprador tiver idade menor que 18, estiver acompanhado e tiver passagem comprada ele não poderá embarcar, pois a seguinte condição não permitirá:

if(idadeComprador >= 18 && temPassagemComprada)

O correto seria:

if(idadeComprador >= 18 || estaAcompanhada == true && temPassagemComprada)

Segue o código completo:

console.log(`Trabalhando com condicionais`);
const listaDeDestinos = new Array(
    `Salvador`,
    `São Paulo`,
    `Rio de Janeiro`
);

const idadeComprador = 17;
const estaAcompanhada = true;
const temPassagemComprada = true;

//.push adiciona um item na lista
listaDeDestinos.push(`Fortaleza`);

console.log(`Destinos possíveis`)
console.log(listaDeDestinos);

if (idadeComprador >= 18 || estaAcompanhada == true) {
    console.log("Passagem comprada com sucesso!");
    listaDeDestinos.splice(3, 1); //Removendo a compra
} else {
    console.log(`Não é maior de idade e não podemos vender.`);
}

console.log("Embarque: \n\n")
if(idadeComprador >= 18 || estaAcompanhada == true && temPassagemComprada == true){
    console.log("Boa Viagem!");
}else{
    console.log("Você não pode embarcar!");
    }


console.log(listaDeDestinos);