Olá Thales, tudo bem? Não entendi muito bem sua dúvida Thales! Poderia explicar melhor? Porque note, se você voltar para um commit específico e então criar um novo branch a partir desse commit e depois fizer vários commit nesse novo branch, e depois fiz ou merge ou rebase para o master ou para outro branch qualquer é normal, todos os commit feitos nessa branch serão incorporados ao branch. E nenhum commit é sobre escritos (isso da branch master). Só serão adicionados os commit dessa nova branch (criada a partir de um commit específico) a branch master.
Fala se entendeu! E qualquer dúvida só falar!