Olá Gabriel,
Executei o seu código e ele apresentou apenas um erro na criação da função mudaCor
function mudaCor {
      //conteúdo
}
Ela está sem os parênteses.
Corrigi esse erro criando-a corretamente colocando os parênteses depois do nome.
function mudaCor() {
      //conteúdo
}
Depois dessa pequena alteração, funcionou corretamente, mudando a cor da bolinha a cada clique com o botão direito do mouse. Fora isso, não há nada de erro com seu código.
Veja o seu código completo após a simples mudança.
<canvas width="600" height="400"></canvas>
<script>
    var tela = document.querySelector('canvas');
    var pincel = tela.getContext('2d');
    pincel.fillStyle = 'grey';
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);
    var cores = ['blue', 'red', 'green']
    var indiceCorAtual = 0; // começa com blue
    function desenhaCirculo(evento) {
        var x = evento.pageX - tela.offsetLeft;
        var y = evento.pageY - tela.offsetTop;
        pincel.fillStyle = cores[indiceCorAtual];
        pincel.beginPath();
        pincel.arc(x, y, 10, 0, 2 * 3.14);
        pincel.fill();
        console.log(x + ',' + y);
    }
    tela.onclick = desenhaCirculo;
    function mudaCor() {
        indiceCorAtual++;
        if(indiceCorAtual >= cores.length) {
            indiceCorAtual = 0; // volta para a primeira cor, azul
        }
        return false; // para não exibir o menu padrão do canvas
    }
    tela.oncontextmenu = mudaCor;
</script>