Oi Abdul, tudo bem? Isso varia de lugar pra lugar e as estratégias podem ser as mais diversas.
Nos anos que trabalhei em agência, a coisa mais rara de acontecer é o cliente pedir acesso. Ele só quer saber dos relatórios na maioria das vezes. Nunca aconteceu comigo. O cliente pode pedir? Pode.
Caso sinta que isso seja viável, crie uma conta para cada cliente.
Caso não ache isso interessante, acredito que você possa fazer o tracking do site em duas contas separadas. Uma delas você pode passar o acesso ao cliente e a outra fica com você.
Até onde sei, você não consegue liberar ao acesso apenas daquele site para o cliente. Uma vez ele abra sua conta, ele vai poder ver todos os sites.