Segue a minha solução nos comentários:
<meta charset="UTF-8">
<script>
function pulaLinha() {
document.write("<br>");
document.write("<br>");
}
function mostra(frase) {
document.write(frase);
pulaLinha();
}
var vitorias = parseInt(prompt("Entre com o número de vitórias."));
// var vitorias = prompt("Entre com o número de vitórias.");
var empates = parseInt(prompt ("Entre com o número de empates."));
//var empates = prompt ("Entre com o número de empates.");
var pontos = vitorias * 3 + empates;
// var pontos = (vitorias * 3) + (empates * 1) ou; >>> Testei da forma comentada e deu certo.
mostra("Os pontos do seu time são " + pontos + ".");
</script>