Ficou bom seu código Antonio.

Mandou bem, excelente codificação! Parabéns

<canvas width="600" height="400"></canvas>

<script>

    var tela = document.querySelector('canvas');
    var pincel = tela.getContext('2d');

    pincel.fillStyle= cor;
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);


    function clear(){
    pincel.clearRect(0, 0, 600, 400);
    }
    var cor= 'white';

function bandeiraBrasil() {
    cor ="green";
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);

    pincel.fillStyle="yellow";
    pincel.beginPath();
    pincel.moveTo(300, 50);
    pincel.lineTo(50, 200);
    pincel.lineTo(550, 200);
    pincel.fill();

    pincel.beginPath();
    pincel.moveTo(50, 200);
    pincel.lineTo(300, 350);
    pincel.lineTo(550, 200);
    pincel.fill();

    pincel.fillStyle="darkblue";
    pincel.beginPath();

    pincel.arc(300, 200, 100, 0, 2* 3.14);
    pincel.fill();
}


function bandeiraAlemanha() {
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 133);

    pincel.fillStyle = 'red';
    pincel.fillRect(0, 133, 600, 133);

    pincel.fillStyle = 'yellow';
    pincel.fillRect(0, 266, 600, 133);
}

var bandeira = true;

function trocaBandeira() {

    if(bandeira == true) {
clear();
        bandeiraBrasil();
        bandeira = false;

    }else {

        bandeiraAlemanha();
        bandeira = true;
    }
}


setInterval(trocaBandeira, 3000);

</script>